Du måste inaktivera projektion av systemintegritet.

1. Starta om datorn medan du startar, håll Command-R intryckt för att starta intorecovery-läge.
2. När du har startat, navigerar du till "Utilities> Terminal" i det övre menyraden.
3. Ange csrutil inaktivera i terminalfönstret och tryck på returtangenten.
4. Starta om maskinen och System Integrity Protection kommer nu att inaktiveras.

källa: http://mattjanik.ca/blog/2015/10/01/refind-on-el-capitan/

Jag vet att det här är en gammal fråga, men jag fick bara gå igenom det här problemet när jag försökte installera rEFInd på en 2015 MBP. När jag försökte installera genom att köra ./refind-install i terminalen fick jag ett meddelande om att integritetsskyddet var aktiverat och jag kunde inte göra en installation utan att starta om till återställningsvolymen. Lösningen utan att inaktivera systemintegritetsskyddet (det finns förmodligen det av goda skäl):

1. Skriv cd ~ / Nedladdningar i terminalen
2. Ladda ner den aktuella installationsfilen med curl -s -L https://sourceforge.net/projects/refind/files/0.10.3/refind-bin-0.10.3.zip
3. packa upp refind-bin-0.10.3.zip
4. Starta om, håll ned cmd + r när klockan låter
5. Öppna verktyg -> Terminal
6. Din hårddisk är inte längre tillgänglig på / eftersom du är på en annan partition. Istället är det nu under / Volumes / {namnet på din hårddisk}. Om du inte redan vet vad det heter (standard är 'Macintosh \ HD') skriver du cd / Volumes och sedan ls för att se det listat där.
7. Skriv cd / volymer / {hårddiskens namn} / användare / {ditt användarnamn} / nedladdningar . Till exempel är min cd / Volumes / Macintosh \ HD / Users / Ayden / Downloads . Kom ihåg att fly från alla mellanslag i katalogen eller filnamnen med '\' och använd fliken för autoslutförande.
8. Skriv ./refind-install --root / Volumes / {Din hårddisk} - ja . Du bör få ett meddelande om avslutad slutförande.
9. Starta om. Du borde se rEFInd. För att se standardstarthanteraren, tryck på alternativknappen medan du startar.

Obs! För att se fler installationsalternativ, skriv vim refind-install i katalogen ~ / Downloads / refind-bin-0.10.3 . De listas högst upp. För att avsluta vim, skriv : q .

Med lanseringen av rEFInd 0.10.0 finns det ingen officiell rEFInd-dokumentation om det här problemet:

http://www.rodsbooks.com/refind/sip.html

Den versionens installationsskript (nu kallat refind-install ) körs också från Recovery HD, och rEFInd kan själv hantera SIP-inställningar, vilket ger två alternativ till frågan.

Som ett alternativ, till exempel om du (som jag) hade tagit bort återställningspartitionen innan du uppgraderade till El Capitan (som inte återställde den), starta upp i ditt rEFInd USB-minne, därifrån starta upp Linux, installera ditt rEFInd Linux-paket och installera rEFInd tillbaka i din HD från Linux.

http://www.zealpeal.com/dual-boot-os-x-el-capitan-on-macbook-pro-with-kali-linux/ kolla den här hela guiden om dubbla starta os x el capitan och installera rEFInd.